Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHRNA2Q15822 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHRNA2Q15822 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHRNA2Q15822 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHRNA2Q15822 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHRNA2Q15822 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHRNA2Q15822 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHRNA2Q15822 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHRNA2Q15822 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CHRNA2Q15822 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHRNA2Q15822 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHRNA2Q15822 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CHRNA2Q15822 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHRNA2Q15822 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHRNA2Q15822 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHRNA2Q15822 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHRNA2Q15822 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHRNA2Q15822 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHRNA2Q15822 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHRNA2Q15822 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHRNA2Q15822 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHRNA2Q15822 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHRNA2Q15822 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHRNA2Q15822 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHRNA2Q15822 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHRNA2Q15822 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHRNA2Q15822 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CHRNA2Q15822 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CHRNA2Q15822 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHRNA2Q15822 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHRNA2Q15822 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHRNA2Q15822 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHRNA2Q15822 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CHRNA2Q15822 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CHRNA2Q15822 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CHRNA2Q15822 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHRNA2Q15822 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHRNA2Q15822 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHRNA2Q15822 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHRNA2Q15822 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHRNA2Q15822 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHRNA2Q15822 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHRNA2Q15822 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHRNA2Q15822 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHRNA2Q15822 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHRNA2Q15822 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHRNA2Q15822 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHRNA2Q15822 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHRNA2Q15822 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHRNA2Q15822 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHRNA2Q15822 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHRNA2Q15822 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHRNA2Q15822 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHRNA2Q15822 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHRNA2Q15822 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHRNA2Q15822 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHRNA2Q15822 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CHRNA2Q15822 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHRNA2Q15822 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHRNA2Q15822 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHRNA2Q15822 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHRNA2Q15822 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHRNA2Q15822 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHRNA2Q15822 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHRNA2Q15822 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHRNA2Q15822 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHRNA2Q15822 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHRNA2Q15822 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHRNA2Q15822 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHRNA2Q15822 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CHRNA2Q15822 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHRNA2Q15822 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHRNA2Q15822 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHRNA2Q15822 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHRNA2Q15822 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHRNA2Q15822 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHRNA2Q15822 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHRNA2Q15822 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHRNA2Q15822 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHRNA2Q15822 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHRNA2Q15822 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CHRNA2Q15822 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHRNA2Q15822 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHRNA2Q15822 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHRNA2Q15822 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHRNA2Q15822 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHRNA2Q15822 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHRNA2Q15822 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHRNA2Q15822 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHRNA2Q15822 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHRNA2Q15822 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHRNA2Q15822 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHRNA2Q15822 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHRNA2Q15822 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHRNA2Q15822 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CHRNA2Q15822 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CHRNA2Q15822 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHRNA2Q15822 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHRNA2Q15822 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHRNA2Q15822 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.12
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