Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF1AQ15573 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF1AQ15573 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF1AQ15573 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF1AQ15573 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF1AQ15573 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF1AQ15573 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF1AQ15573 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF1AQ15573 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF1AQ15573 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF1AQ15573 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF1AQ15573 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF1AQ15573 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF1AQ15573 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF1AQ15573 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF1AQ15573 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF1AQ15573 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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TAF1AQ15573 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF1AQ15573 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF1AQ15573 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF1AQ15573 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF1AQ15573 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1AQ15573 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1AQ15573 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1AQ15573 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1AQ15573 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1AQ15573 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1AQ15573 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1AQ15573 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1AQ15573 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1AQ15573 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1AQ15573 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1AQ15573 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1AQ15573 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1AQ15573 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF1AQ15573 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF1AQ15573 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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TAF1AQ15573 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF1AQ15573 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF1AQ15573 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF1AQ15573 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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TAF1AQ15573 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF1AQ15573 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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TAF1AQ15573 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF1AQ15573 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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TAF1AQ15573 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
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TAF1AQ15573 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF1AQ15573 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF1AQ15573 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF1AQ15573 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF1AQ15573 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF1AQ15573 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF1AQ15573 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF1AQ15573 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF1AQ15573 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF1AQ15573 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF1AQ15573 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF1AQ15573 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF1AQ15573 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF1AQ15573 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF1AQ15573 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF1AQ15573 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
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