Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.041e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.023e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.023e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 RNASEH2A-203ENST00000590279 696 ntTSL 321.37■■□□□ 1.013e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 MBD3-208ENST00000590830 1035 ntTSL 1 (best)21.32■■□□□ 13e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 13e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 13e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ACSS2-216ENST00000484354 517 ntTSL 521.24■□□□□ 0.993e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.993e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.983e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 GCLC-203ENST00000504525 1011 ntTSL 321.17■□□□□ 0.983e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 TAF1B-206ENST00000469895 681 ntTSL 321.13■□□□□ 0.973e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.973e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 RPL22-206ENST00000480661 2279 ntTSL 1 (best)21.09■□□□□ 0.978e-9■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.959e-7■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ZNF664-212ENST00000542820 802 ntTSL 1 (best)21■□□□□ 0.953e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.944e-7■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 PYCR3-206ENST00000482616 830 ntTSL 220.91■□□□□ 0.943e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 DIXDC1-204ENST00000528399 741 ntTSL 220.9■□□□□ 0.943e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.943e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.933e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CBARP-205ENST00000591127 933 ntTSL 520.81■□□□□ 0.923e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.922e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 PYCR3-204ENST00000447926 1324 ntTSL 220.74■□□□□ 0.913e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.913e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 RPL22-204ENST00000465387 508 ntTSL 220.71■□□□□ 0.918e-9■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 TMEM189-205ENST00000453505 2028 ntTSL 1 (best)20.69■□□□□ 0.93e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.92e-7■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 MBD6-202ENST00000546632 607 ntTSL 220.65■□□□□ 0.93e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 JADE2-206ENST00000431355 887 ntTSL 320.61■□□□□ 0.893e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.893e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 RFLNA-203ENST00000389727 2385 ntAPPRIS P2 TSL 520.58■□□□□ 0.893e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.883e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.883e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.871e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 DIMT1-203ENST00000509182 961 ntTSL 220.48■□□□□ 0.871e-9■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 DIMT1-205ENST00000514911 1034 ntTSL 520.48■□□□□ 0.871e-9■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.862e-11■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 RFX5-213ENST00000450506 903 ntTSL 320.41■□□□□ 0.863e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 DCP1B-206ENST00000541700 948 ntTSL 520.4■□□□□ 0.863e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ZNF664-210ENST00000541448 567 ntTSL 320.27■□□□□ 0.843e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.833e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 POLR3H-206ENST00000431534 1464 ntTSL 520.25■□□□□ 0.833e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ANGEL1-204ENST00000556298 727 ntTSL 220.19■□□□□ 0.823e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 KIAA1211-208ENST00000636006 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 520.18■□□□□ 0.823e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.794e-8■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.793e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NFKB2-202ENST00000336486 851 ntTSL 320■□□□□ 0.793e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.793e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.783e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 MBD6-210ENST00000549623 544 ntTSL 419.93■□□□□ 0.783e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 SSU72-204ENST00000378726 2238 ntTSL 219.85■□□□□ 0.773e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.773e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ARMC6-217ENST00000541898 1198 ntTSL 219.83■□□□□ 0.773e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ARMC6-204ENST00000535288 622 ntTSL 419.83■□□□□ 0.773e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.763e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 PGS1-204ENST00000586325 537 ntTSL 419.74■□□□□ 0.753e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 PTPRU-203ENST00000415600 1590 ntTSL 519.73■□□□□ 0.753e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.754e-7■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.752e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.743e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.731e-9■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 RNASEH2A-202ENST00000590121 859 ntTSL 219.63■□□□□ 0.733e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 FCHO1-232ENST00000600209 881 ntTSL 519.6■□□□□ 0.731e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 MFSD10-203ENST00000503596 1589 ntTSL 519.6■□□□□ 0.733e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.723e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 LIN9-202ENST00000359525 686 ntTSL 319.56■□□□□ 0.729e-8■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ACAD8-205ENST00000524547 703 ntTSL 319.54■□□□□ 0.723e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 PHLDB1-207ENST00000526374 591 ntTSL 219.53■□□□□ 0.723e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 MMP25-AS1-208ENST00000573953 1001 ntTSL 319.52■□□□□ 0.723e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.713e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ARPC1B-219ENST00000484600 582 ntTSL 219.45■□□□□ 0.73e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 TMEM189-204ENST00000371658 813 ntTSL 319.43■□□□□ 0.73e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.73e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 MAST3-204ENST00000609076 449 ntTSL 319.39■□□□□ 0.693e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.693e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NCOR2-223ENST00000542565 746 ntTSL 319.32■□□□□ 0.683e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.683e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.683e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.683e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ZNF335-202ENST00000475002 1721 ntTSL 219.28■□□□□ 0.683e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.673e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ABHD16A-216ENST00000498420 1137 ntTSL 519.13■□□□□ 0.652e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.653e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.653e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.643e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.642e-8■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 WRAP73-204ENST00000424367 940 ntTSL 519.02■□□□□ 0.643e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 WRAP73-206ENST00000469643 563 ntTSL 219.02■□□□□ 0.643e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ZNF513-203ENST00000436006 510 ntTSL 219.01■□□□□ 0.633e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 RAC3-202ENST00000580965 831 ntTSL 219■□□□□ 0.633e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ATP13A2-204ENST00000463860 1639 ntTSL 218.99■□□□□ 0.633e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ARMC6-209ENST00000536098 563 ntTSL 518.98■□□□□ 0.633e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.635e-7■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.623e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 RIN1-206ENST00000530745 1872 ntTSL 518.94■□□□□ 0.623e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 FBXO3-212ENST00000533103 570 ntTSL 418.93■□□□□ 0.623e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.623e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.613e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CORO1B-203ENST00000453768 1161 ntTSL 218.89■□□□□ 0.613e-6■■■■■ 41.9
Retrieved 100 of 48,698 protein–RNA pairs in 1626.9 ms