Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms