Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
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