Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEDD9Q14511 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEDD9Q14511 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEDD9Q14511 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEDD9Q14511 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NEDD9Q14511 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEDD9Q14511 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEDD9Q14511 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NEDD9Q14511 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NEDD9Q14511 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEDD9Q14511 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEDD9Q14511 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEDD9Q14511 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEDD9Q14511 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEDD9Q14511 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEDD9Q14511 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEDD9Q14511 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEDD9Q14511 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEDD9Q14511 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEDD9Q14511 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NEDD9Q14511 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEDD9Q14511 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEDD9Q14511 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEDD9Q14511 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEDD9Q14511 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
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