Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SF3B2Q13435 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SF3B2Q13435 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SF3B2Q13435 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SF3B2Q13435 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SF3B2Q13435 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SF3B2Q13435 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SF3B2Q13435 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SF3B2Q13435 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SF3B2Q13435 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SF3B2Q13435 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SF3B2Q13435 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SF3B2Q13435 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SF3B2Q13435 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SF3B2Q13435 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SF3B2Q13435 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SF3B2Q13435 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SF3B2Q13435 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SF3B2Q13435 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SF3B2Q13435 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SF3B2Q13435 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SF3B2Q13435 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SF3B2Q13435 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SF3B2Q13435 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SF3B2Q13435 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SF3B2Q13435 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SF3B2Q13435 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SF3B2Q13435 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SF3B2Q13435 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SF3B2Q13435 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SF3B2Q13435 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SF3B2Q13435 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SF3B2Q13435 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SF3B2Q13435 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SF3B2Q13435 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SF3B2Q13435 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SF3B2Q13435 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SF3B2Q13435 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SF3B2Q13435 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SF3B2Q13435 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SF3B2Q13435 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SF3B2Q13435 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SF3B2Q13435 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SF3B2Q13435 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SF3B2Q13435 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SF3B2Q13435 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SF3B2Q13435 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SF3B2Q13435 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SF3B2Q13435 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SF3B2Q13435 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SF3B2Q13435 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SF3B2Q13435 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SF3B2Q13435 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SF3B2Q13435 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SF3B2Q13435 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SF3B2Q13435 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SF3B2Q13435 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SF3B2Q13435 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SF3B2Q13435 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SF3B2Q13435 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SF3B2Q13435 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SF3B2Q13435 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SF3B2Q13435 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SF3B2Q13435 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SF3B2Q13435 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SF3B2Q13435 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SF3B2Q13435 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SF3B2Q13435 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SF3B2Q13435 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SF3B2Q13435 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SF3B2Q13435 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SF3B2Q13435 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SF3B2Q13435 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SF3B2Q13435 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SF3B2Q13435 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SF3B2Q13435 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SF3B2Q13435 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SF3B2Q13435 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SF3B2Q13435 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SF3B2Q13435 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SF3B2Q13435 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SF3B2Q13435 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SF3B2Q13435 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SF3B2Q13435 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SF3B2Q13435 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SF3B2Q13435 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SF3B2Q13435 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SF3B2Q13435 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SF3B2Q13435 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SF3B2Q13435 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SF3B2Q13435 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SF3B2Q13435 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SF3B2Q13435 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SF3B2Q13435 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SF3B2Q13435 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SF3B2Q13435 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SF3B2Q13435 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SF3B2Q13435 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SF3B2Q13435 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SF3B2Q13435 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
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