Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
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