Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDE3BQ13370 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDE3BQ13370 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDE3BQ13370 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDE3BQ13370 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDE3BQ13370 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
PDE3BQ13370 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PDE3BQ13370 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PDE3BQ13370 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PDE3BQ13370 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
PDE3BQ13370 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PDE3BQ13370 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PDE3BQ13370 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PDE3BQ13370 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PDE3BQ13370 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PDE3BQ13370 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PDE3BQ13370 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PDE3BQ13370 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PDE3BQ13370 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PDE3BQ13370 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PDE3BQ13370 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PDE3BQ13370 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PDE3BQ13370 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PDE3BQ13370 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PDE3BQ13370 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PDE3BQ13370 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PDE3BQ13370 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PDE3BQ13370 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PDE3BQ13370 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PDE3BQ13370 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PDE3BQ13370 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PDE3BQ13370 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PDE3BQ13370 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PDE3BQ13370 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PDE3BQ13370 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PDE3BQ13370 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PDE3BQ13370 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PDE3BQ13370 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PDE3BQ13370 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PDE3BQ13370 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PDE3BQ13370 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PDE3BQ13370 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PDE3BQ13370 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PDE3BQ13370 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PDE3BQ13370 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PDE3BQ13370 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PDE3BQ13370 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PDE3BQ13370 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PDE3BQ13370 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PDE3BQ13370 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PDE3BQ13370 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PDE3BQ13370 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PDE3BQ13370 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PDE3BQ13370 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PDE3BQ13370 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PDE3BQ13370 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PDE3BQ13370 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PDE3BQ13370 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PDE3BQ13370 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PDE3BQ13370 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PDE3BQ13370 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PDE3BQ13370 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PDE3BQ13370 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PDE3BQ13370 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PDE3BQ13370 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PDE3BQ13370 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PDE3BQ13370 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
PDE3BQ13370 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
PDE3BQ13370 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PDE3BQ13370 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PDE3BQ13370 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PDE3BQ13370 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PDE3BQ13370 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PDE3BQ13370 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PDE3BQ13370 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDE3BQ13370 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDE3BQ13370 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDE3BQ13370 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDE3BQ13370 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDE3BQ13370 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDE3BQ13370 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDE3BQ13370 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDE3BQ13370 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDE3BQ13370 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDE3BQ13370 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PDE3BQ13370 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PDE3BQ13370 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PDE3BQ13370 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PDE3BQ13370 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PDE3BQ13370 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PDE3BQ13370 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PDE3BQ13370 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PDE3BQ13370 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PDE3BQ13370 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PDE3BQ13370 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PDE3BQ13370 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PDE3BQ13370 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PDE3BQ13370 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PDE3BQ13370 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PDE3BQ13370 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms