Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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SKP2Q13309 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
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SKP2Q13309 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
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