Protein–RNA interactions for Protein: Q13285

NR5A1, Steroidogenic factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR5A1Q13285 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NR5A1Q13285 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NR5A1Q13285 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NR5A1Q13285 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NR5A1Q13285 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NR5A1Q13285 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NR5A1Q13285 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NR5A1Q13285 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NR5A1Q13285 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NR5A1Q13285 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NR5A1Q13285 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NR5A1Q13285 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NR5A1Q13285 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NR5A1Q13285 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NR5A1Q13285 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NR5A1Q13285 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NR5A1Q13285 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NR5A1Q13285 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NR5A1Q13285 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NR5A1Q13285 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NR5A1Q13285 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NR5A1Q13285 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NR5A1Q13285 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NR5A1Q13285 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NR5A1Q13285 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NR5A1Q13285 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NR5A1Q13285 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NR5A1Q13285 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NR5A1Q13285 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NR5A1Q13285 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NR5A1Q13285 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NR5A1Q13285 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NR5A1Q13285 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NR5A1Q13285 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NR5A1Q13285 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NR5A1Q13285 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms