Protein–RNA interactions for Protein: Q13217

DNAJC3, DnaJ homolog subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC3Q13217 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAJC3Q13217 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAJC3Q13217 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAJC3Q13217 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAJC3Q13217 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAJC3Q13217 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAJC3Q13217 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAJC3Q13217 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAJC3Q13217 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAJC3Q13217 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAJC3Q13217 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAJC3Q13217 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAJC3Q13217 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAJC3Q13217 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAJC3Q13217 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAJC3Q13217 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAJC3Q13217 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAJC3Q13217 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAJC3Q13217 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAJC3Q13217 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAJC3Q13217 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAJC3Q13217 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAJC3Q13217 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAJC3Q13217 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAJC3Q13217 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAJC3Q13217 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAJC3Q13217 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAJC3Q13217 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAJC3Q13217 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAJC3Q13217 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAJC3Q13217 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAJC3Q13217 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAJC3Q13217 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAJC3Q13217 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAJC3Q13217 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAJC3Q13217 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAJC3Q13217 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAJC3Q13217 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAJC3Q13217 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAJC3Q13217 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAJC3Q13217 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAJC3Q13217 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAJC3Q13217 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAJC3Q13217 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAJC3Q13217 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAJC3Q13217 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAJC3Q13217 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAJC3Q13217 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAJC3Q13217 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAJC3Q13217 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAJC3Q13217 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAJC3Q13217 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAJC3Q13217 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAJC3Q13217 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAJC3Q13217 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAJC3Q13217 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAJC3Q13217 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAJC3Q13217 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAJC3Q13217 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAJC3Q13217 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAJC3Q13217 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAJC3Q13217 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAJC3Q13217 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAJC3Q13217 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAJC3Q13217 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAJC3Q13217 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAJC3Q13217 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAJC3Q13217 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAJC3Q13217 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DNAJC3Q13217 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNAJC3Q13217 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNAJC3Q13217 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNAJC3Q13217 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
DNAJC3Q13217 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNAJC3Q13217 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNAJC3Q13217 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNAJC3Q13217 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNAJC3Q13217 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNAJC3Q13217 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNAJC3Q13217 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNAJC3Q13217 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNAJC3Q13217 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNAJC3Q13217 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNAJC3Q13217 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNAJC3Q13217 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAJC3Q13217 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAJC3Q13217 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAJC3Q13217 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAJC3Q13217 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAJC3Q13217 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAJC3Q13217 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAJC3Q13217 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAJC3Q13217 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAJC3Q13217 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAJC3Q13217 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAJC3Q13217 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAJC3Q13217 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAJC3Q13217 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAJC3Q13217 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAJC3Q13217 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms