Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
HSPB3Q12988 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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