Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms