Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FOXF1Q12946 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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