Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
HMGXB3Q12766 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
HMGXB3Q12766 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.72■■■■□ 3.63
HMGXB3Q12766 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
HMGXB3Q12766 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
HMGXB3Q12766 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
HMGXB3Q12766 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
HMGXB3Q12766 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
HMGXB3Q12766 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
HMGXB3Q12766 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC37.71■■■■□ 3.63
HMGXB3Q12766 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
HMGXB3Q12766 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC37.71■■■■□ 3.63
HMGXB3Q12766 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
HMGXB3Q12766 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
HMGXB3Q12766 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
HMGXB3Q12766 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
HMGXB3Q12766 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
HMGXB3Q12766 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
HMGXB3Q12766 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC37.71■■■■□ 3.63
HMGXB3Q12766 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
HMGXB3Q12766 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
HMGXB3Q12766 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
HMGXB3Q12766 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.71■■■■□ 3.63
HMGXB3Q12766 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
HMGXB3Q12766 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
HMGXB3Q12766 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
HMGXB3Q12766 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC37.71■■■■□ 3.63
HMGXB3Q12766 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
HMGXB3Q12766 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
HMGXB3Q12766 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
HMGXB3Q12766 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
HMGXB3Q12766 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
HMGXB3Q12766 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
HMGXB3Q12766 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
HMGXB3Q12766 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
HMGXB3Q12766 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
HMGXB3Q12766 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
HMGXB3Q12766 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
HMGXB3Q12766 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
HMGXB3Q12766 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC37.69■■■■□ 3.62
HMGXB3Q12766 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
HMGXB3Q12766 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
HMGXB3Q12766 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
HMGXB3Q12766 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
HMGXB3Q12766 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
HMGXB3Q12766 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
HMGXB3Q12766 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
HMGXB3Q12766 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
HMGXB3Q12766 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
HMGXB3Q12766 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
HMGXB3Q12766 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
HMGXB3Q12766 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
HMGXB3Q12766 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
HMGXB3Q12766 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC37.67■■■■□ 3.62
HMGXB3Q12766 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
HMGXB3Q12766 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
HMGXB3Q12766 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
HMGXB3Q12766 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
HMGXB3Q12766 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
HMGXB3Q12766 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.66■■■■□ 3.62
HMGXB3Q12766 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC37.66■■■■□ 3.62
HMGXB3Q12766 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
HMGXB3Q12766 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.66■■■■□ 3.62
HMGXB3Q12766 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
HMGXB3Q12766 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
HMGXB3Q12766 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
HMGXB3Q12766 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC37.66■■■■□ 3.62
HMGXB3Q12766 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
HMGXB3Q12766 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
HMGXB3Q12766 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
HMGXB3Q12766 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
HMGXB3Q12766 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
HMGXB3Q12766 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC37.65■■■■□ 3.62
HMGXB3Q12766 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
HMGXB3Q12766 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
HMGXB3Q12766 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
HMGXB3Q12766 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
HMGXB3Q12766 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
HMGXB3Q12766 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
HMGXB3Q12766 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
HMGXB3Q12766 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
HMGXB3Q12766 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
HMGXB3Q12766 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.62
HMGXB3Q12766 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
HMGXB3Q12766 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.62
HMGXB3Q12766 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.62
HMGXB3Q12766 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
HMGXB3Q12766 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
HMGXB3Q12766 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
HMGXB3Q12766 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
HMGXB3Q12766 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.61
HMGXB3Q12766 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
HMGXB3Q12766 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
HMGXB3Q12766 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
HMGXB3Q12766 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
HMGXB3Q12766 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.61
HMGXB3Q12766 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
HMGXB3Q12766 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
HMGXB3Q12766 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
HMGXB3Q12766 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
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