Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms