Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SLFN5Q08AF3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SLFN5Q08AF3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLFN5Q08AF3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLFN5Q08AF3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLFN5Q08AF3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SLFN5Q08AF3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLFN5Q08AF3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLFN5Q08AF3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLFN5Q08AF3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLFN5Q08AF3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLFN5Q08AF3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLFN5Q08AF3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLFN5Q08AF3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLFN5Q08AF3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SLFN5Q08AF3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLFN5Q08AF3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SLFN5Q08AF3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLFN5Q08AF3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLFN5Q08AF3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLFN5Q08AF3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLFN5Q08AF3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLFN5Q08AF3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLFN5Q08AF3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLFN5Q08AF3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLFN5Q08AF3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLFN5Q08AF3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SLFN5Q08AF3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SLFN5Q08AF3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLFN5Q08AF3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLFN5Q08AF3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLFN5Q08AF3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLFN5Q08AF3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLFN5Q08AF3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLFN5Q08AF3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLFN5Q08AF3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLFN5Q08AF3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLFN5Q08AF3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLFN5Q08AF3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLFN5Q08AF3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SLFN5Q08AF3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLFN5Q08AF3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLFN5Q08AF3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLFN5Q08AF3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLFN5Q08AF3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLFN5Q08AF3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLFN5Q08AF3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLFN5Q08AF3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLFN5Q08AF3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLFN5Q08AF3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLFN5Q08AF3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLFN5Q08AF3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLFN5Q08AF3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLFN5Q08AF3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLFN5Q08AF3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLFN5Q08AF3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SLFN5Q08AF3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
SLFN5Q08AF3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SLFN5Q08AF3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SLFN5Q08AF3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLFN5Q08AF3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLFN5Q08AF3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLFN5Q08AF3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLFN5Q08AF3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLFN5Q08AF3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SLFN5Q08AF3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLFN5Q08AF3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLFN5Q08AF3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLFN5Q08AF3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLFN5Q08AF3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLFN5Q08AF3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLFN5Q08AF3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLFN5Q08AF3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLFN5Q08AF3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLFN5Q08AF3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLFN5Q08AF3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLFN5Q08AF3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLFN5Q08AF3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLFN5Q08AF3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLFN5Q08AF3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLFN5Q08AF3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLFN5Q08AF3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLFN5Q08AF3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLFN5Q08AF3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLFN5Q08AF3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLFN5Q08AF3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLFN5Q08AF3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLFN5Q08AF3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLFN5Q08AF3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLFN5Q08AF3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLFN5Q08AF3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLFN5Q08AF3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLFN5Q08AF3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLFN5Q08AF3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLFN5Q08AF3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLFN5Q08AF3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLFN5Q08AF3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLFN5Q08AF3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLFN5Q08AF3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLFN5Q08AF3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms