Protein–RNA interactions for Protein: Q08962

NIP7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NIP7Q08962 YBR300CYBR300C 498 nt2.4□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 RPO41YFL036W 4056 nt2.4□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 CCT7YJL111W 1653 nt2.4□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 CHS3YBR023C 3498 nt2.4□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 VAC8YEL013W 1737 nt2.39□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 MNT3YIL014W 1893 nt2.39□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 TPO5YKL174C 1857 nt2.39□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 EXO84YBR102C 2262 nt2.39□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 CIK1YMR198W 1785 nt2.39□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 GYL1YMR192W 2163 nt2.39□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 RRG1YDR065W 1098 nt2.39□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 RPS25AYGR027C 327 nt2.39□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 EFG1YGR271C-A 702 nt2.39□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 YIL174WYIL174W 228 nt2.39□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.39□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 YLR042CYLR042C 486 nt2.39□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 ATG5YPL149W 885 nt2.39□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 ESL2YKR096W 3588 nt2.39□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 SEC26YDR238C 2922 nt2.39□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 WHI3YNL197C 1986 nt2.39□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 YGR067CYGR067C 2415 nt2.39□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 NDT80YHR124W 1884 nt2.39□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 ROM1YGR070W 3468 nt2.38□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 RAX2YLR084C 3663 nt2.38□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 ESC1YMR219W 4977 nt2.38□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 RIX1YHR197W 2292 nt2.38□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 YGL006W-AYGL006W-A 111 nt2.38□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 YGR073CYGR073C 372 nt2.38□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 PRE8YML092C 753 nt2.38□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 AAR2YBL074C 1068 nt2.38□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 MSN1YOL116W 1149 nt2.38□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 BUD21YOR078W 645 nt2.38□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 POL30YBR088C 777 nt2.38□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 SPP381YBR152W 876 nt2.38□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 RSE1YML049C 4086 nt2.38□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 KAP104YBR017C 2757 nt2.38□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 TAO3YIL129C 7131 nt2.37□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 DIA2YOR080W 2199 nt2.37□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 RTT10YPL183C 3042 nt2.37□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 HFM1YGL251C 3564 nt2.37□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 SLP1YOR154W 1764 nt2.37□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 YCR045W-AYCR045W-A 351 nt2.37□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 AIM6YDL237W 1173 nt2.37□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 ECM11YDR446W 909 nt2.37□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 IMP3YHR148W 552 nt2.37□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 YIL161WYIL161W 708 nt2.37□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 LAC1YKL008C 1257 nt2.37□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 JIP3YLR331C 378 nt2.37□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 YLR400WYLR400W 474 nt2.37□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 SEC65YML105C 822 nt2.37□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 PPT2YPL148C 522 nt2.37□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 ARA1YBR149W 1035 nt2.37□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 APD1YBR151W 951 nt2.37□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 SMC2YFR031C 3513 nt2.37□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 VPS9YML097C 1356 nt2.36□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 AXL1YPR122W 3627 nt2.36□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 SMX2YFL017W-A 234 nt2.36□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 YGL138CYGL138C 1038 nt2.36□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 YGL218WYGL218W 651 nt2.36□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 MPC3YGR243W 441 nt2.36□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 GLG2YJL137C 1143 nt2.36□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 YAL031W-AYAL031W-A 309 nt2.36□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 TDA8YAL064C-A 381 nt2.36□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 SIC1YLR079W 855 nt2.36□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 RPS10BYMR230W 318 nt2.36□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 DUG3YNL191W 1074 nt2.36□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 SSU72YNL222W 621 nt2.36□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 IRC3YDR332W 2070 nt2.36□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 MPS1YDL028C 2295 nt2.36□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 YLR446WYLR446W 1302 nt2.36□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 PDC2YDR081C 2778 nt2.36□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 GIN4YDR507C 3429 nt2.36□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 PSP1YDR505C 2526 nt2.35□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 RMT2YDR465C 1239 nt2.35□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 PNC1YGL037C 651 nt2.35□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 YIR023C-AYIR023C-A 324 nt2.35□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 YLR076CYLR076C 423 nt2.35□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 MCT1YOR221C 1083 nt2.35□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 SSP2YOR242C 1116 nt2.35□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 SUT2YPR009W 807 nt2.35□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 IKI3YLR384C 4050 nt2.35□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 YLR001CYLR001C 2589 nt2.35□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 SEC7YDR170C 6030 nt2.35□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 TRA1YHR099W 11235 nt2.35□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt2.35□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 MUS81YDR386W 1899 nt2.35□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 NET1YJL076W 3570 nt2.34□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 HBT1YDL223C 3141 nt2.34□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 YDR535CYDR535C 501 nt2.34□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 BRR6YGL247W 594 nt2.34□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 RPL14BYHL001W 417 nt2.34□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 RPS22AYJL190C 393 nt2.34□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 YKL162CYKL162C 1209 nt2.34□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 YMR075C-AYMR075C-A 366 nt2.34□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 NAB3YPL190C 2409 nt2.34□□□□□ -2.03
NIP7Q08962 SRC1YML034W 2505 nt2.34□□□□□ -2.04
NIP7Q08962 BNI4YNL233W 2679 nt2.34□□□□□ -2.04
NIP7Q08962 SOK1YDR006C 2706 nt2.33□□□□□ -2.04
NIP7Q08962 RNH202YDR279W 1053 nt2.33□□□□□ -2.04
NIP7Q08962 RTT105YER104W 627 nt2.33□□□□□ -2.04
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