Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms