Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DHX9Q08211 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DHX9Q08211 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DHX9Q08211 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DHX9Q08211 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DHX9Q08211 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DHX9Q08211 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DHX9Q08211 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DHX9Q08211 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DHX9Q08211 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DHX9Q08211 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DHX9Q08211 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DHX9Q08211 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DHX9Q08211 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DHX9Q08211 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DHX9Q08211 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DHX9Q08211 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DHX9Q08211 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DHX9Q08211 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DHX9Q08211 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DHX9Q08211 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms