Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms