Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms