Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LTBQ06643 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LTBQ06643 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LTBQ06643 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LTBQ06643 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LTBQ06643 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LTBQ06643 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LTBQ06643 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LTBQ06643 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LTBQ06643 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LTBQ06643 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LTBQ06643 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LTBQ06643 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LTBQ06643 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LTBQ06643 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LTBQ06643 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LTBQ06643 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LTBQ06643 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LTBQ06643 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LTBQ06643 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LTBQ06643 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LTBQ06643 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LTBQ06643 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LTBQ06643 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LTBQ06643 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LTBQ06643 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
LTBQ06643 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LTBQ06643 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LTBQ06643 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LTBQ06643 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LTBQ06643 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LTBQ06643 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LTBQ06643 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LTBQ06643 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
LTBQ06643 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LTBQ06643 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LTBQ06643 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LTBQ06643 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
LTBQ06643 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LTBQ06643 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LTBQ06643 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LTBQ06643 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LTBQ06643 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LTBQ06643 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LTBQ06643 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LTBQ06643 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LTBQ06643 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LTBQ06643 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LTBQ06643 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LTBQ06643 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LTBQ06643 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LTBQ06643 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LTBQ06643 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LTBQ06643 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LTBQ06643 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LTBQ06643 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LTBQ06643 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
LTBQ06643 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LTBQ06643 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LTBQ06643 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LTBQ06643 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
LTBQ06643 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LTBQ06643 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LTBQ06643 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LTBQ06643 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LTBQ06643 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LTBQ06643 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LTBQ06643 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LTBQ06643 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LTBQ06643 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LTBQ06643 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LTBQ06643 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LTBQ06643 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LTBQ06643 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LTBQ06643 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LTBQ06643 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LTBQ06643 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LTBQ06643 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LTBQ06643 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LTBQ06643 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LTBQ06643 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LTBQ06643 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LTBQ06643 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LTBQ06643 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LTBQ06643 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LTBQ06643 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LTBQ06643 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LTBQ06643 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LTBQ06643 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LTBQ06643 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LTBQ06643 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LTBQ06643 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LTBQ06643 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LTBQ06643 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LTBQ06643 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LTBQ06643 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LTBQ06643 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LTBQ06643 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LTBQ06643 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LTBQ06643 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms