Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms