Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC18A2Q05940 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC18A2Q05940 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC18A2Q05940 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC18A2Q05940 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC18A2Q05940 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC18A2Q05940 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC18A2Q05940 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC18A2Q05940 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC18A2Q05940 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC18A2Q05940 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC18A2Q05940 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC18A2Q05940 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC18A2Q05940 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC18A2Q05940 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC18A2Q05940 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC18A2Q05940 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC18A2Q05940 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC18A2Q05940 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC18A2Q05940 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC18A2Q05940 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC18A2Q05940 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC18A2Q05940 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC18A2Q05940 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC18A2Q05940 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC18A2Q05940 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC18A2Q05940 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC18A2Q05940 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC18A2Q05940 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC18A2Q05940 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC18A2Q05940 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC18A2Q05940 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC18A2Q05940 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC18A2Q05940 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC18A2Q05940 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC18A2Q05940 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC18A2Q05940 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC18A2Q05940 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC18A2Q05940 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC18A2Q05940 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC18A2Q05940 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC18A2Q05940 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC18A2Q05940 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC18A2Q05940 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC18A2Q05940 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC18A2Q05940 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC18A2Q05940 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC18A2Q05940 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC18A2Q05940 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC18A2Q05940 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC18A2Q05940 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC18A2Q05940 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC18A2Q05940 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC18A2Q05940 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC18A2Q05940 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC18A2Q05940 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC18A2Q05940 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC18A2Q05940 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC18A2Q05940 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC18A2Q05940 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC18A2Q05940 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC18A2Q05940 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC18A2Q05940 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC18A2Q05940 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC18A2Q05940 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SLC18A2Q05940 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SLC18A2Q05940 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SLC18A2Q05940 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms