Protein–RNA interactions for Protein: Q05397

PTK2, Focal adhesion kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK2Q05397 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms