Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CD164Q04900 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CD164Q04900 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CD164Q04900 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CD164Q04900 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CD164Q04900 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CD164Q04900 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CD164Q04900 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CD164Q04900 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CD164Q04900 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
CD164Q04900 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CD164Q04900 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CD164Q04900 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CD164Q04900 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CD164Q04900 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CD164Q04900 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CD164Q04900 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CD164Q04900 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CD164Q04900 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CD164Q04900 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CD164Q04900 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CD164Q04900 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CD164Q04900 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CD164Q04900 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CD164Q04900 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CD164Q04900 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CD164Q04900 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CD164Q04900 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CD164Q04900 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CD164Q04900 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CD164Q04900 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CD164Q04900 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CD164Q04900 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CD164Q04900 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CD164Q04900 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CD164Q04900 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
CD164Q04900 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.42
CD164Q04900 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CD164Q04900 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CD164Q04900 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CD164Q04900 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.42
CD164Q04900 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CD164Q04900 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
CD164Q04900 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CD164Q04900 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
CD164Q04900 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CD164Q04900 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CD164Q04900 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CD164Q04900 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CD164Q04900 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CD164Q04900 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CD164Q04900 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CD164Q04900 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CD164Q04900 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CD164Q04900 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CD164Q04900 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CD164Q04900 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CD164Q04900 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CD164Q04900 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CD164Q04900 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CD164Q04900 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CD164Q04900 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CD164Q04900 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
CD164Q04900 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CD164Q04900 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CD164Q04900 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CD164Q04900 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CD164Q04900 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CD164Q04900 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CD164Q04900 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
CD164Q04900 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CD164Q04900 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CD164Q04900 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CD164Q04900 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
CD164Q04900 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CD164Q04900 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CD164Q04900 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CD164Q04900 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CD164Q04900 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CD164Q04900 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CD164Q04900 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CD164Q04900 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CD164Q04900 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CD164Q04900 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CD164Q04900 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CD164Q04900 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CD164Q04900 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CD164Q04900 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CD164Q04900 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CD164Q04900 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
CD164Q04900 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CD164Q04900 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CD164Q04900 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CD164Q04900 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CD164Q04900 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CD164Q04900 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CD164Q04900 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CD164Q04900 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CD164Q04900 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CD164Q04900 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms