Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms