Protein–RNA interactions for Protein: Q03167

TGFBR3, Transforming growth factor beta receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR3Q03167 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TGFBR3Q03167 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TGFBR3Q03167 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TGFBR3Q03167 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TGFBR3Q03167 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TGFBR3Q03167 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TGFBR3Q03167 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TGFBR3Q03167 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGFBR3Q03167 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGFBR3Q03167 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGFBR3Q03167 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGFBR3Q03167 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGFBR3Q03167 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGFBR3Q03167 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGFBR3Q03167 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGFBR3Q03167 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TGFBR3Q03167 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGFBR3Q03167 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGFBR3Q03167 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGFBR3Q03167 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGFBR3Q03167 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGFBR3Q03167 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGFBR3Q03167 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGFBR3Q03167 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGFBR3Q03167 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGFBR3Q03167 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGFBR3Q03167 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGFBR3Q03167 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGFBR3Q03167 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGFBR3Q03167 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGFBR3Q03167 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGFBR3Q03167 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGFBR3Q03167 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGFBR3Q03167 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGFBR3Q03167 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGFBR3Q03167 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGFBR3Q03167 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGFBR3Q03167 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TGFBR3Q03167 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TGFBR3Q03167 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TGFBR3Q03167 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms