Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms