Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms