Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms