Protein–RNA interactions for Protein: Q00604

NDP, Norrin, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDPQ00604 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDPQ00604 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NDPQ00604 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDPQ00604 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDPQ00604 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NDPQ00604 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDPQ00604 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDPQ00604 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDPQ00604 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDPQ00604 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDPQ00604 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDPQ00604 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDPQ00604 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDPQ00604 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDPQ00604 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDPQ00604 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDPQ00604 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDPQ00604 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDPQ00604 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDPQ00604 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDPQ00604 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDPQ00604 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDPQ00604 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDPQ00604 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDPQ00604 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDPQ00604 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDPQ00604 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDPQ00604 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDPQ00604 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDPQ00604 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDPQ00604 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDPQ00604 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDPQ00604 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDPQ00604 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDPQ00604 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDPQ00604 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDPQ00604 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDPQ00604 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDPQ00604 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDPQ00604 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDPQ00604 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDPQ00604 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NDPQ00604 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDPQ00604 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDPQ00604 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDPQ00604 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDPQ00604 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDPQ00604 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDPQ00604 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDPQ00604 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDPQ00604 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDPQ00604 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDPQ00604 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDPQ00604 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDPQ00604 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDPQ00604 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDPQ00604 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDPQ00604 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDPQ00604 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDPQ00604 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDPQ00604 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDPQ00604 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDPQ00604 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NDPQ00604 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDPQ00604 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDPQ00604 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDPQ00604 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDPQ00604 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDPQ00604 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDPQ00604 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDPQ00604 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDPQ00604 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDPQ00604 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDPQ00604 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDPQ00604 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDPQ00604 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NDPQ00604 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NDPQ00604 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDPQ00604 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDPQ00604 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDPQ00604 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NDPQ00604 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDPQ00604 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDPQ00604 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDPQ00604 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDPQ00604 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDPQ00604 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDPQ00604 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDPQ00604 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDPQ00604 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDPQ00604 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDPQ00604 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDPQ00604 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDPQ00604 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDPQ00604 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDPQ00604 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDPQ00604 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDPQ00604 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDPQ00604 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDPQ00604 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms