Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2BQ00403 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms