Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms