Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSBP2P81877 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSBP2P81877 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSBP2P81877 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSBP2P81877 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSBP2P81877 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSBP2P81877 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSBP2P81877 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSBP2P81877 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSBP2P81877 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SSBP2P81877 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSBP2P81877 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSBP2P81877 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSBP2P81877 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SSBP2P81877 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSBP2P81877 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSBP2P81877 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSBP2P81877 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSBP2P81877 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP2P81877 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP2P81877 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP2P81877 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP2P81877 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP2P81877 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP2P81877 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP2P81877 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP2P81877 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP2P81877 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP2P81877 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP2P81877 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP2P81877 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP2P81877 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP2P81877 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP2P81877 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP2P81877 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP2P81877 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP2P81877 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP2P81877 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP2P81877 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP2P81877 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP2P81877 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP2P81877 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP2P81877 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP2P81877 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP2P81877 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms