Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
IRX6P78412 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
IRX6P78412 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IRX6P78412 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IRX6P78412 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
IRX6P78412 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
IRX6P78412 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IRX6P78412 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
IRX6P78412 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IRX6P78412 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IRX6P78412 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IRX6P78412 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IRX6P78412 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IRX6P78412 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
IRX6P78412 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IRX6P78412 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IRX6P78412 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IRX6P78412 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
IRX6P78412 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IRX6P78412 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IRX6P78412 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IRX6P78412 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
IRX6P78412 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IRX6P78412 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IRX6P78412 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IRX6P78412 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IRX6P78412 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IRX6P78412 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IRX6P78412 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
IRX6P78412 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IRX6P78412 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IRX6P78412 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IRX6P78412 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IRX6P78412 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IRX6P78412 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IRX6P78412 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IRX6P78412 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IRX6P78412 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IRX6P78412 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
IRX6P78412 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
IRX6P78412 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
IRX6P78412 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
IRX6P78412 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
IRX6P78412 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
IRX6P78412 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
IRX6P78412 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
IRX6P78412 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
IRX6P78412 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
IRX6P78412 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
IRX6P78412 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
IRX6P78412 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
IRX6P78412 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
IRX6P78412 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
IRX6P78412 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
IRX6P78412 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
IRX6P78412 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
IRX6P78412 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
IRX6P78412 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
IRX6P78412 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
IRX6P78412 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
IRX6P78412 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
IRX6P78412 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
IRX6P78412 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
IRX6P78412 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
IRX6P78412 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
IRX6P78412 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
IRX6P78412 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
IRX6P78412 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
IRX6P78412 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
IRX6P78412 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
IRX6P78412 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
IRX6P78412 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IRX6P78412 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IRX6P78412 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IRX6P78412 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IRX6P78412 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IRX6P78412 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
IRX6P78412 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IRX6P78412 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
IRX6P78412 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
IRX6P78412 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IRX6P78412 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IRX6P78412 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
IRX6P78412 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IRX6P78412 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IRX6P78412 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IRX6P78412 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IRX6P78412 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
IRX6P78412 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
IRX6P78412 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IRX6P78412 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
IRX6P78412 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
IRX6P78412 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
IRX6P78412 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
IRX6P78412 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IRX6P78412 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
IRX6P78412 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
IRX6P78412 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
IRX6P78412 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
IRX6P78412 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms