Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms