Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMO4P61968 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMO4P61968 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMO4P61968 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMO4P61968 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LMO4P61968 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMO4P61968 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMO4P61968 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMO4P61968 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMO4P61968 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMO4P61968 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMO4P61968 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMO4P61968 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMO4P61968 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMO4P61968 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LMO4P61968 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMO4P61968 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMO4P61968 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMO4P61968 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMO4P61968 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMO4P61968 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMO4P61968 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMO4P61968 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMO4P61968 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMO4P61968 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMO4P61968 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMO4P61968 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMO4P61968 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMO4P61968 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMO4P61968 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMO4P61968 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMO4P61968 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMO4P61968 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMO4P61968 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMO4P61968 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMO4P61968 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMO4P61968 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMO4P61968 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMO4P61968 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMO4P61968 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMO4P61968 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LMO4P61968 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMO4P61968 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
LMO4P61968 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
LMO4P61968 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMO4P61968 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMO4P61968 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMO4P61968 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMO4P61968 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMO4P61968 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMO4P61968 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMO4P61968 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMO4P61968 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMO4P61968 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMO4P61968 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMO4P61968 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMO4P61968 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMO4P61968 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMO4P61968 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMO4P61968 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMO4P61968 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMO4P61968 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LMO4P61968 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LMO4P61968 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMO4P61968 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMO4P61968 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMO4P61968 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMO4P61968 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMO4P61968 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMO4P61968 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO4P61968 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO4P61968 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO4P61968 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO4P61968 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO4P61968 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO4P61968 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO4P61968 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO4P61968 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO4P61968 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO4P61968 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO4P61968 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO4P61968 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO4P61968 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO4P61968 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO4P61968 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO4P61968 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO4P61968 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO4P61968 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO4P61968 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO4P61968 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO4P61968 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO4P61968 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO4P61968 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO4P61968 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO4P61968 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO4P61968 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMO4P61968 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMO4P61968 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMO4P61968 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMO4P61968 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms