Protein–RNA interactions for Protein: P61020

RAB5B, Ras-related protein Rab-5B, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5BP61020 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms