Protein–RNA interactions for Protein: P61019

RAB2A, Ras-related protein Rab-2A, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB2AP61019 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB2AP61019 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB2AP61019 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB2AP61019 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB2AP61019 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB2AP61019 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB2AP61019 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB2AP61019 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms