Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms