Protein–RNA interactions for Protein: P57768

SNX16, Sorting nexin-16, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16P57768 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX16P57768 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX16P57768 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX16P57768 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX16P57768 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX16P57768 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX16P57768 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX16P57768 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX16P57768 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX16P57768 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX16P57768 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX16P57768 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX16P57768 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX16P57768 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX16P57768 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX16P57768 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX16P57768 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX16P57768 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX16P57768 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX16P57768 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX16P57768 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX16P57768 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX16P57768 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX16P57768 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX16P57768 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX16P57768 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX16P57768 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX16P57768 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX16P57768 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX16P57768 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX16P57768 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX16P57768 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX16P57768 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX16P57768 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX16P57768 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX16P57768 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX16P57768 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX16P57768 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX16P57768 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX16P57768 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX16P57768 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX16P57768 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX16P57768 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX16P57768 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX16P57768 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX16P57768 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX16P57768 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX16P57768 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX16P57768 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX16P57768 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX16P57768 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX16P57768 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX16P57768 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX16P57768 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX16P57768 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX16P57768 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX16P57768 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX16P57768 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX16P57768 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX16P57768 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX16P57768 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX16P57768 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX16P57768 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX16P57768 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX16P57768 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX16P57768 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX16P57768 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX16P57768 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX16P57768 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX16P57768 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX16P57768 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX16P57768 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX16P57768 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX16P57768 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX16P57768 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX16P57768 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX16P57768 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX16P57768 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX16P57768 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX16P57768 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX16P57768 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX16P57768 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX16P57768 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX16P57768 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX16P57768 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX16P57768 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX16P57768 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX16P57768 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX16P57768 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX16P57768 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX16P57768 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX16P57768 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX16P57768 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX16P57768 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX16P57768 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX16P57768 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX16P57768 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX16P57768 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX16P57768 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX16P57768 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms