Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BACE1P56817 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BACE1P56817 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BACE1P56817 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BACE1P56817 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BACE1P56817 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BACE1P56817 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BACE1P56817 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BACE1P56817 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BACE1P56817 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BACE1P56817 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BACE1P56817 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BACE1P56817 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BACE1P56817 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BACE1P56817 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BACE1P56817 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BACE1P56817 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BACE1P56817 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BACE1P56817 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BACE1P56817 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BACE1P56817 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BACE1P56817 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BACE1P56817 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BACE1P56817 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BACE1P56817 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
BACE1P56817 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BACE1P56817 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BACE1P56817 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BACE1P56817 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BACE1P56817 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BACE1P56817 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BACE1P56817 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BACE1P56817 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BACE1P56817 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BACE1P56817 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BACE1P56817 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BACE1P56817 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BACE1P56817 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
BACE1P56817 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BACE1P56817 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BACE1P56817 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BACE1P56817 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BACE1P56817 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BACE1P56817 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BACE1P56817 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BACE1P56817 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BACE1P56817 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BACE1P56817 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BACE1P56817 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BACE1P56817 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BACE1P56817 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BACE1P56817 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BACE1P56817 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
BACE1P56817 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
BACE1P56817 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BACE1P56817 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BACE1P56817 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BACE1P56817 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BACE1P56817 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BACE1P56817 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BACE1P56817 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BACE1P56817 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BACE1P56817 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BACE1P56817 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
BACE1P56817 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BACE1P56817 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BACE1P56817 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BACE1P56817 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BACE1P56817 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BACE1P56817 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BACE1P56817 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BACE1P56817 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BACE1P56817 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BACE1P56817 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BACE1P56817 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BACE1P56817 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BACE1P56817 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BACE1P56817 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BACE1P56817 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BACE1P56817 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BACE1P56817 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BACE1P56817 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BACE1P56817 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BACE1P56817 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BACE1P56817 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
BACE1P56817 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BACE1P56817 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BACE1P56817 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BACE1P56817 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BACE1P56817 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BACE1P56817 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BACE1P56817 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BACE1P56817 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BACE1P56817 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BACE1P56817 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BACE1P56817 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BACE1P56817 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BACE1P56817 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BACE1P56817 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BACE1P56817 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms