Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NME5P56597 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NME5P56597 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NME5P56597 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NME5P56597 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NME5P56597 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NME5P56597 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NME5P56597 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME5P56597 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME5P56597 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME5P56597 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME5P56597 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME5P56597 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME5P56597 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME5P56597 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME5P56597 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME5P56597 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME5P56597 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME5P56597 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME5P56597 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME5P56597 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NME5P56597 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME5P56597 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME5P56597 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NME5P56597 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME5P56597 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME5P56597 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME5P56597 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME5P56597 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME5P56597 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME5P56597 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME5P56597 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME5P56597 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NME5P56597 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NME5P56597 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NME5P56597 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NME5P56597 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NME5P56597 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NME5P56597 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NME5P56597 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NME5P56597 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NME5P56597 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NME5P56597 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NME5P56597 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NME5P56597 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NME5P56597 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NME5P56597 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NME5P56597 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME5P56597 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME5P56597 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME5P56597 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME5P56597 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME5P56597 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME5P56597 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME5P56597 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME5P56597 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME5P56597 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME5P56597 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME5P56597 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME5P56597 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME5P56597 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME5P56597 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME5P56597 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME5P56597 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME5P56597 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME5P56597 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME5P56597 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME5P56597 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NME5P56597 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NME5P56597 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NME5P56597 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NME5P56597 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NME5P56597 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NME5P56597 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NME5P56597 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NME5P56597 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NME5P56597 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NME5P56597 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NME5P56597 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NME5P56597 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NME5P56597 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NME5P56597 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NME5P56597 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NME5P56597 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NME5P56597 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NME5P56597 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NME5P56597 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NME5P56597 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NME5P56597 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NME5P56597 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NME5P56597 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NME5P56597 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NME5P56597 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NME5P56597 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NME5P56597 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NME5P56597 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NME5P56597 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NME5P56597 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NME5P56597 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NME5P56597 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms