Protein–RNA interactions for Protein: P56182

RRP1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1P56182 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
RRP1P56182 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RRP1P56182 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RRP1P56182 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RRP1P56182 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RRP1P56182 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RRP1P56182 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RRP1P56182 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RRP1P56182 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RRP1P56182 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RRP1P56182 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RRP1P56182 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RRP1P56182 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RRP1P56182 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RRP1P56182 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RRP1P56182 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RRP1P56182 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RRP1P56182 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RRP1P56182 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RRP1P56182 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RRP1P56182 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RRP1P56182 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RRP1P56182 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RRP1P56182 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RRP1P56182 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RRP1P56182 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RRP1P56182 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RRP1P56182 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RRP1P56182 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RRP1P56182 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RRP1P56182 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RRP1P56182 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RRP1P56182 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RRP1P56182 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RRP1P56182 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RRP1P56182 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
RRP1P56182 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RRP1P56182 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RRP1P56182 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RRP1P56182 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RRP1P56182 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RRP1P56182 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RRP1P56182 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RRP1P56182 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RRP1P56182 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RRP1P56182 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RRP1P56182 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RRP1P56182 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RRP1P56182 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RRP1P56182 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RRP1P56182 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RRP1P56182 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RRP1P56182 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RRP1P56182 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RRP1P56182 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RRP1P56182 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RRP1P56182 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RRP1P56182 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RRP1P56182 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RRP1P56182 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RRP1P56182 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RRP1P56182 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RRP1P56182 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RRP1P56182 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RRP1P56182 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RRP1P56182 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RRP1P56182 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RRP1P56182 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RRP1P56182 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RRP1P56182 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RRP1P56182 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RRP1P56182 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RRP1P56182 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RRP1P56182 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RRP1P56182 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RRP1P56182 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RRP1P56182 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RRP1P56182 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RRP1P56182 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RRP1P56182 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RRP1P56182 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RRP1P56182 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RRP1P56182 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRP1P56182 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRP1P56182 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRP1P56182 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRP1P56182 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRP1P56182 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRP1P56182 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRP1P56182 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRP1P56182 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRP1P56182 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RRP1P56182 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRP1P56182 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RRP1P56182 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RRP1P56182 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RRP1P56182 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RRP1P56182 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RRP1P56182 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RRP1P56182 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms