Protein–RNA interactions for Protein: P55209

NAP1L1, Nucleosome assembly protein 1-like 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L1P55209 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms