Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms