Protein–RNA interactions for Protein: P53794

SLC5A3, Sodium/myo-inositol cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A3P53794 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms